La CTS assure également la desserte de deux établissements d'accueil de personnes handicapées, l'Institut d'Education Motrice "Les Iris" et l'association régionale "L'aide aux handicapés moteurs".
La CTS dispose pour cela de 5 conducteurs et de 5 bus spécialement adaptés, équipés d'ancrages pour chaises roulantes, de sangles pour les sièges, d'un monte-charge intégral déplié à chaque ouverture de porte. 5 circuits sont particulièrement étudiés et permettent une prise en charge fine des handicapés l'un après l'autre, entre 7h et 8h30 et entre 16h et 18h.
Les conducteurs, spécialement formés, disposent de l'ensemble des coordonnées de la famille afin d'être en permanence à leur écoute (retard au point de prise en charge, non-prise en charge pour maladie ou autre motif...).